Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl11Q9CXW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms