Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms