Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp27Q8CEG8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms