Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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