Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCAQ16586 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCAQ16586 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms