Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 CUP9YPL177C 921 nt1.9□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 UBS1YBR165W 834 nt1.9□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 KOG1YHR186C 4674 nt1.9□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RLF2YPR018W 1821 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 COG3YER157W 2406 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YKL075CYKL075C 1353 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SNX41YDR425W 1878 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SEM1YDR363W-A 270 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RPS24AYER074W 408 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ATP7YKL016C 525 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 HYM1YKL189W 1200 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ATG10YLL042C 504 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RPL36AYMR194W 303 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 CSI2YOL007C 1026 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ARF3YOR094W 552 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ARP5YNL059C 2268 nt1.89□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 FKS1YLR342W 5631 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 TPS2YDR074W 2691 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SCY1YGL083W 2415 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 URK1YNR012W 1506 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 VAB2YEL005C 849 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SVP26YHR181W 687 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YJL202CYJL202C 348 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YKL115CYKL115C 393 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 VPH2YKL119C 648 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 UBC12YLR306W 567 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 NPR3YHL023C 3441 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YPK1YKL126W 2043 nt1.88□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ROY1YMR258C 1662 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RUB1YDR139C 234 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RPL22BYFL034C-A 369 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YGR053CYGR053C 852 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 IRC8YJL051W 2469 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YLL044WYLL044W 447 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 MTG1YMR097C 1104 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RGM1YMR182C 636 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RRT16YNL105W 429 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ATX1YNL259C 222 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YOR283WYOR283W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 CBP6YBR120C 489 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SRP1YNL189W 1629 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 ALY1YKR021W 2748 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SIP3YNL257C 3690 nt1.87□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 CST9YLR394W 1449 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 BFR1YOR198C 1413 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YER189WYER189W 369 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 BRP1YGL007W 378 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 PET191YJR034W 327 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YMR320WYMR320W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YOL162WYOL162W 648 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 PSK2YOL045W 3306 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 HRD3YLR207W 2502 nt1.86□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SLK19YOR195W 2466 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 TOF1YNL273W 3717 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 INP51YIL002C 2841 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SNA4YDL123W 423 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YRB1YDR002W 606 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 TIF35YDR429C 825 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YER119C-AYER119C-A 372 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 CTK2YJL006C 972 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YKR070WYKR070W 1059 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 RNP1YLL046C 750 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YNL046WYNL046W 519 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 GRE2YOL151W 1029 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SGT1YOR057W 1188 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 PET20YPL159C 762 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SEC66YBR171W 621 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 DAD3YBR233W-A 285 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 HSC82YMR186W 2118 nt1.85□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 TIM9YEL020W-A 264 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 TWF1YGR080W 999 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 CKA1YIL035C 1119 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 AIM19YIL087C 474 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 SHG1YBR258C 429 nt1.84□□□□□ -2.11
NIP7Q08962 YDR338CYDR338C 2088 nt1.84□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 GPI17YDR434W 1605 nt1.84□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 GYP5YPL249C 2685 nt1.84□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 NPR1YNL183C 2373 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 MRP10YDL045W-A 288 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 ATC1YDR184C 885 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 CBS2YDR197W 1170 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 GPI19YDR437W 423 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 YER091C-AYER091C-A 222 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 OST5YGL226C-A 261 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 RPL11BYGR085C 525 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 ECI1YLR284C 843 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 DGR1YNL130C-A 147 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 RPL25YOL127W 429 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 RPL11AYPR102C 525 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 snR24snR24 89 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 BAS1YKR099W 2436 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 SSP1YHR184W 1716 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 RGL1YPL066W 1440 nt1.83□□□□□ -2.12
NIP7Q08962 NGG1YDR176W 2109 nt1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 107.7 ms