Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD1P98174 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD1P98174 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGD1P98174 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGD1P98174 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms