Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2kP61087 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2kP61087 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms