Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP4BP1P59074 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms