Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPC1P35052 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms