Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc5P32043 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms