Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx3P23198 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms