Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd2P13011 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms