Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Tnp1P10856 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms