Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXB5P09067 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB5P09067 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms