Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX16O60231 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX16O60231 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DHX16O60231 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DHX16O60231 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DHX16O60231 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DHX16O60231 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms