Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsmbO08540 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsmbO08540 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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