Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDY1Q9Y6F8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDY1Q9Y6F8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms