Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL20Q9Y2M5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms