Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clec4eQ9R0Q8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms