Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFA4L2Q9NRX3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFA4L2Q9NRX3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms