Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF3Q9NR23 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms