Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVK-5Q9HDB9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-5Q9HDB9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-5Q9HDB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-5Q9HDB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-5Q9HDB9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms