Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clvs1Q9D4C9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clvs1Q9D4C9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms