Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHANK3Q9BYB0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SHANK3Q9BYB0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms