Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBM42Q9BTD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBM42Q9BTD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms