Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms