Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmagpQ99KC7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SmagpQ99KC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SmagpQ99KC7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms