Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD3Q96L08 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms