Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CARMIL3Q8ND23 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARMIL3Q8ND23 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms