Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2BQ8N4Y2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms