Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uhrf2Q7TMI3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uhrf2Q7TMI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms