Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USPL1Q5W0Q7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USPL1Q5W0Q7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms