Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM29Q5VYK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECM29Q5VYK3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms