Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf135Q5VTT2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms