Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SF3B2Q13435 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SF3B2Q13435 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SF3B2Q13435 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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