Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK17Q00537 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms