Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRB1P82279 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRB1P82279 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRB1P82279 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRB1P82279 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRB1P82279 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRB1P82279 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRB1P82279 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms