Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab2aP53994 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab2aP53994 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab2aP53994 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab2aP53994 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab2aP53994 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab2aP53994 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms