Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms