Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fv4P11370 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fv4P11370 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fv4P11370 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms