Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB5O95377 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB5O95377 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB5O95377 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB5O95377 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB5O95377 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB5O95377 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB5O95377 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB5O95377 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms