Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TULP3O75386 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TULP3O75386 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TULP3O75386 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TULP3O75386 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TULP3O75386 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TULP3O75386 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TULP3O75386 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TULP3O75386 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TULP3O75386 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms