Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms