Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC048679D3YXE9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC048679D3YXE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms