Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP17L4A6NCW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L4A6NCW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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