Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT87PA6NCN2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT87PA6NCN2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms