Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vamp5Q9Z2P8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vamp5Q9Z2P8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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