Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGTPBP1Q9UPW5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms