Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms